Carbone et al., 2016
Genetic architecture of natural variation in visual senescence in Drosophila
[10.1073/pnas.1613833113][FBrf0233864]

Description

Study of the age-dependent decline in phototaxis (innate tendency to move toward the light) at 1, 2, and 4 weeks, as a proxy for visual senescence

Comments from curator

Each individual fly is assigned a score from 1 (did not move toward the light) to 8 (moved toward the light seven times).

Phenotyping data comes from Dataset S1 in file pnas.1613833113.sd01.xlsx and Dataset S4 in file pnas.1613833113.sd04.xlsx (Dark/Light phenotype) of the Supporting Information section.

Of note, authors are also using the longevity/lifespan data from Ivanov et al., 2015 in Fig. S4

192 DGRP lines 7 unavailable 173 available 12 genotyped

DGRP_021 DGRP_026 DGRP_028 DGRP_038 DGRP_040 DGRP_041 DGRP_042 DGRP_045 DGRP_049 DGRP_057 DGRP_059 DGRP_069 DGRP_073 DGRP_075 DGRP_083 DGRP_085 DGRP_088 DGRP_091 DGRP_093 DGRP_101 DGRP_105 DGRP_109 DGRP_129 DGRP_136 DGRP_138 DGRP_142 DGRP_149 DGRP_153 DGRP_158 DGRP_161 DGRP_176 DGRP_177 DGRP_181 DGRP_189 DGRP_195 DGRP_208 DGRP_217 DGRP_223 DGRP_227 DGRP_228 DGRP_229 DGRP_233 DGRP_235 DGRP_237 DGRP_239 DGRP_256 DGRP_272 DGRP_280 DGRP_287 DGRP_301 DGRP_303 DGRP_304 DGRP_306 DGRP_307 DGRP_309 DGRP_310 DGRP_313 DGRP_315 DGRP_317 DGRP_318 DGRP_320 DGRP_321 DGRP_324 DGRP_325 DGRP_332 DGRP_335 DGRP_336 DGRP_338 DGRP_340 DGRP_350 DGRP_352 DGRP_356 DGRP_357 DGRP_358 DGRP_359 DGRP_360 DGRP_361 DGRP_362 DGRP_365 DGRP_367 DGRP_370 DGRP_371 DGRP_373 DGRP_374 DGRP_375 DGRP_377 DGRP_378 DGRP_379 DGRP_380 DGRP_381 DGRP_382 DGRP_383 DGRP_385 DGRP_386 DGRP_387 DGRP_391 DGRP_392 DGRP_398 DGRP_399 DGRP_405 DGRP_406 DGRP_409 DGRP_426 DGRP_427 DGRP_437 DGRP_439 DGRP_440 DGRP_441 DGRP_443 DGRP_461 DGRP_476 DGRP_486 DGRP_491 DGRP_492 DGRP_502 DGRP_508 DGRP_509 DGRP_513 DGRP_514 DGRP_517 DGRP_530 DGRP_531 DGRP_535 DGRP_554 DGRP_555 DGRP_563 DGRP_584 DGRP_589 DGRP_595 DGRP_639 DGRP_642 DGRP_646 DGRP_703 DGRP_705 DGRP_707 DGRP_712 DGRP_714 DGRP_716 DGRP_721 DGRP_727 DGRP_730 DGRP_732 DGRP_737 DGRP_738 DGRP_748 DGRP_757 DGRP_761 DGRP_765 DGRP_774 DGRP_776 DGRP_783 DGRP_786 DGRP_787 DGRP_790 DGRP_796 DGRP_799 DGRP_801 DGRP_802 DGRP_804 DGRP_805 DGRP_808 DGRP_810 DGRP_812 DGRP_818 DGRP_819 DGRP_820 DGRP_821 DGRP_822 DGRP_832 DGRP_837 DGRP_843 DGRP_849 DGRP_850 DGRP_852 DGRP_853 DGRP_855 DGRP_857 DGRP_859 DGRP_861 DGRP_879 DGRP_882 DGRP_884 DGRP_887 DGRP_890 DGRP_892 DGRP_894 DGRP_897 DGRP_900 DGRP_907 DGRP_908 DGRP_911 DGRP_913

Datasets

Dataset	Phenotypes	DGRP lines
Summary dataset	10 phenotypes mn_PhototaxDark_wk1 mn_PhototaxLight_wk1 mn_PhototaxisScor_1w mn_PhototaxisScor_2w mn_PhototaxisScor_4w se_PhototaxDark_wk1 se_PhototaxLight_wk1 se_PhototaxisScor_1w se_PhototaxisScor_2w se_PhototaxisScor_4w	192 DGRP lines DGRP_021 DGRP_026 DGRP_028 DGRP_038 DGRP_040 DGRP_041 DGRP_042 DGRP_045 DGRP_049 DGRP_057 DGRP_059 DGRP_069 DGRP_073 DGRP_075 DGRP_083 DGRP_085 DGRP_088 DGRP_091 DGRP_093 DGRP_101 DGRP_105 DGRP_109 DGRP_129 DGRP_136 DGRP_138 DGRP_142 DGRP_149 DGRP_153 DGRP_158 DGRP_161 DGRP_176 DGRP_177 DGRP_181 DGRP_189 DGRP_195 DGRP_208 DGRP_217 DGRP_223 DGRP_227 DGRP_228 DGRP_229 DGRP_233 DGRP_235 DGRP_237 DGRP_239 DGRP_256 DGRP_272 DGRP_280 DGRP_287 DGRP_301 DGRP_303 DGRP_304 DGRP_306 DGRP_307 DGRP_309 DGRP_310 DGRP_313 DGRP_315 DGRP_317 DGRP_318 DGRP_320 DGRP_321 DGRP_324 DGRP_325 DGRP_332 DGRP_335 DGRP_336 DGRP_338 DGRP_340 DGRP_350 DGRP_352 DGRP_356 DGRP_357 DGRP_358 DGRP_359 DGRP_360 DGRP_361 DGRP_362 DGRP_365 DGRP_367 DGRP_370 DGRP_371 DGRP_373 DGRP_374 DGRP_375 DGRP_377 DGRP_378 DGRP_379 DGRP_380 DGRP_381 DGRP_382 DGRP_383 DGRP_385 DGRP_386 DGRP_387 DGRP_391 DGRP_392 DGRP_398 DGRP_399 DGRP_405 DGRP_406 DGRP_409 DGRP_426 DGRP_427 DGRP_437 DGRP_439 DGRP_440 DGRP_441 DGRP_443 DGRP_461 DGRP_476 DGRP_486 DGRP_491 DGRP_492 DGRP_502 DGRP_508 DGRP_509 DGRP_513 DGRP_514 DGRP_517 DGRP_530 DGRP_531 DGRP_535 DGRP_554 DGRP_555 DGRP_563 DGRP_584 DGRP_589 DGRP_595 DGRP_639 DGRP_642 DGRP_646 DGRP_703 DGRP_705 DGRP_707 DGRP_712 DGRP_714 DGRP_716 DGRP_721 DGRP_727 DGRP_730 DGRP_732 DGRP_737 DGRP_738 DGRP_748 DGRP_757 DGRP_761 DGRP_765 DGRP_774 DGRP_776 DGRP_783 DGRP_786 DGRP_787 DGRP_790 DGRP_796 DGRP_799 DGRP_801 DGRP_802 DGRP_804 DGRP_805 DGRP_808 DGRP_810 DGRP_812 DGRP_818 DGRP_819 DGRP_820 DGRP_821 DGRP_822 DGRP_832 DGRP_837 DGRP_843 DGRP_849 DGRP_850 DGRP_852 DGRP_853 DGRP_855 DGRP_857 DGRP_859 DGRP_861 DGRP_879 DGRP_882 DGRP_884 DGRP_887 DGRP_890 DGRP_892 DGRP_894 DGRP_897 DGRP_900 DGRP_907 DGRP_908 DGRP_911 DGRP_913	Download